Pokémon Pinball Rubí y Zafiro es un juego de Pinball que está basado en las versiones de los juegos Pokémon Rubí y Zafiro de la tercera generación de Pokémon

Consta de 2 tableros: un tablero Rubí y un tablero Zafiro, cada uno con características diferentes.

Como cualquier otro juego de GBA de Pokémon, cuenta con un Pokédex que muestra la información de los Pokémon que ya has capturado y cuenta con la opción de escuchar su grito. Hay diferentes modos de atrapar Pokémon: ya sea golpeándolos con la Pokéball, abriendo huevos o pasando algún bonus. Hay una tienda Pokémon para comprar mejoras de Pokéball, salvadores, etc. Los Pokémon saldrán según la localización del centro del tablero. Existe la posibilidad de viajar a distintos campos y lugares para atrapar a más Pokémon.

Existe el modo de hacer que la Pokéball se convierta en Superball, la Superball se conviertá en Ultraball y la Ultraball se conviertá en Masterball; esto te dará más puntos al atrapar a algún Pokémon o hacer otras cosas, como golpear botones, superar bonus, etc, pero si tu ball cae, o pasa un determinado tiempo, tendrás que repetir el proceso de conversión desde el principio